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Short Time-series Expression Miner (STEM) 短时间序列表达挖掘器（STEM）是一个Java程序，用于聚类，比较和可视化来自微阵列实验（约8个时间点或更少）的短时间序列基因表达数据。STEM使研究人员能…

R计算data.frame行row平均方法有2种 ：rowMeans()和apply() 创建data.frame,计算平均分Avg_score df1 = data.frame( Name = c(‘Pyyy’,&…

网址： http://www.idtdna.com/pages/scitools  高级的Oligo、RNAi、CRISPR、Genotyping序列、qPCR引物设计和分析。 有一套完整的生物信息学工具，可以预测天然和化学修饰的核酸的特性…

网址：http://amplicon.sourceforge.net/ 简介：用于聚合酶链反应（PCR）实验的寡核苷酸（引物）设计是成功获得所需PCR产物（扩增子）的重要阶段。PCR引物设计可通过软件来辅助，该软件可帮助用户评估寡核苷酸的特…

网址：http://discover.nci.nih.gov/affyprobeminer/ 功能：研究并重新定义的Affymetrix芯片数据。 AffyProbeMiner是一种计算效率低的平台独立工具，使用了所有RefSeq成熟RNA…

网址：http://bioalgo.iit.cnr.it/amica 用于基因芯片基因表达数据的轻量级多方法聚类引擎。 具有 Euclidean distance、Pearson coefficient、City block distanc…

Gene Quantification平台描述并总结了使用实时qPCR和dPCR进行定量基因表达分析的所有技术方面。 它介绍了许多新的和创新的qPCR和dPCR应用，化学，方法，算法，MIQE和QC策略，循环仪，试剂盒，染料，分析方法，事件和涉及的服务。

网站：http://aclame.ulb.ac.be/ 无论是在给定的基因组内（细胞内迁移）还是细菌细胞之间（细胞间迁移），原核移动遗传元件（MGE）都是动员基因的主要角色。传统上，MGE被分类为噬菌体，质粒或转座子。随着许多嵌合元素的鉴定…

dplyr与安装 dplyr是一个强大的R软件包，用于处理，清理和汇总非结构化数据。简而言之，它使得R中的数据探索和数据操作变得简单快捷。 最简单的方法是安装 tidyverse包: install.packages(“tidyverse”…

利用R将gene symbol与id转换 安装所需包 if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE)) install.packages(“Bio…