DNA序列数据库和分析工具

  • DNA和RNA数据库

    核酸序列数据库主要包括了基因组DNA序列,mRNA序列,tRNA序列,rRNA序列等核酸序列。国家上有三个主要核苷酸序列公共数据库: 位于英国剑桥的欧洲分子生物学实验室的欧洲核苷酸档案库(ENA) 位于美国的生物技术信息中心的GeneBan…

    09/12/2021
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  • 分子生物学数据库和数据格式

    数据库记录包括两部分: 1.原始序列数据 2.描述原始数据的生物学信息的注释 随着研究的积累,生物信息数据越来越多,且在研究中,如果仅仅知道数据的来源 而对其他方面知之甚少,研究也会变得极为困难。 所以为了研究的便利,能够对数据进行存储共享…

    09/12/2021
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  • 3D-footprint DNA结合蛋白数据库

    3D foot是一个可提供蛋白质数据库中所有蛋白质-DNA复合物的结合特异性估计值的数据库。 Web界面允许用户:(i)通过关键字浏览DNA结合蛋白; (ii)查找可识别相似DNA基序的蛋白质,以及(iii)BLAST相似DNA结合蛋白,突…

    04/10/2020
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  • 置顶 IDT SciTools高级引物序列设计

    网址: http://www.idtdna.com/pages/scitools  高级的Oligo、RNAi、CRISPR、Genotyping序列、qPCR引物设计和分析。 有一套完整的生物信息学工具,可以预测天然和化学修饰的核酸的特性…

    03/19/2020
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  • Amplicon 在对齐的DNA序列组上设计PCR引物

    网址:http://amplicon.sourceforge.net/ 简介:用于聚合酶链反应(PCR)实验的寡核苷酸(引物)设计是成功获得所需PCR产物(扩增子)的重要阶段。PCR引物设计可通过软件来辅助,该软件可帮助用户评估寡核苷酸的特…

    03/19/2020
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  • Academic and Industrial Information Platform for qPCR

    Gene Quantification平台描述并总结了使用实时qPCR和dPCR进行定量基因表达分析的所有技术方面。 它介绍了许多新的和创新的qPCR和dPCR应用,化学,方法,算法,MIQE和QC策略,循环仪,试剂盒,染料,分析方法,事件和涉及的服务。

    03/18/2020
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  • ACLAME — A CLAssification of Mobile genetic Elements

    网站:http://aclame.ulb.ac.be/ 无论是在给定的基因组内(细胞内迁移)还是细菌细胞之间(细胞间迁移),原核移动遗传元件(MGE)都是动员基因的主要角色。传统上,MGE被分类为噬菌体,质粒或转座子。随着许多嵌合元素的鉴定…

    03/18/2020
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