生物信息技术
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序列比对
比较是科学研究中最常见的研究方法之一，通过比较寻找研究对象可能具备的某些特征和特性。序列比较的理论基础是进化学说：如果两个序列之间具有足够高的相似性，那么两者可能是共同的进化祖先经过序列内残基的替换，残基或序列片段的缺失或插入以及序列重组等…
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Mac常用快捷键
Finder 快捷键 作用 备注 Command + ↑ 返回上一层 Command + ↓ 进入当前文件夹 Shift + Command + G 前往指定路径的文件夹 包括隐藏文件夹 Shift + Command + . 显示隐藏文件…
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R：字符大小写转换
R：字符大小写转换 >x = “CAGGGT” #定义字符串变量x >tolower(x) [1] “caggt” #将x中的字符全部转换为小写字母 >y = tolower…
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CRISPR 设计和Off Target预测：tefor
1.在线网站 http://crispor.tefor.net/ 2.界面简洁，step1输入KO的序列，step2/3中选择相应的选项即可获得信息。
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RNAseq:mRNA表达FPKM标准话原理和计算方法
mRNA Expression HT-Seq Normalization RNA-Seq expression level read counts produced by HT-Seq are normalized using two si…
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3D UMAP R分析代码
# LOAD LIBRARIES ##### Restart Rstudio or R# Run the following code once you have Seurat installed library(ggplot2) libr…
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R:Bioconductor设置国内镜像
Bioconductor安装包出现无法打开url https://bioconductor.org/install/,可以通过修改国内镜像解决，代码如下： 运行安装命令 BiocManager::install(“DOSE…
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had non-zero exit status
解决方案1：install.packages(‘*package_name’, dependencies = TRUE)
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edgeR：RNAseq差异基因比较
Empirical analysis of digital gene expression data in R 安装： source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)bioc…
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Clustal：多序列比对分析、序列同源性分析
Clustal是一个单机版的基于渐进比对的多序列比对工具，由Higgins D.G.等开发。有应用于多种操作系统平台的版本，包括linux版，DOS版的clustlw，clustalx等。CLUSTAL是一种渐进的比对方法，先将多个序列两两…
