生物信息技术
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常用R包安装命令
if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE)) install.packages(“BiocManager”) BiocManager::install( c(“AnnoPr…
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R:circos.heatmap-绘制环形热图包
The circos.heatmap() function Circular heatmaps are pretty. With circlize package, it is possible to implement circular …
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安装Seurat-data包
SeuratData 是一种利用 R 的内部软件包和数据管理系统以 Seurat 对象形式分发数据集的机制。它为用户访问 Seurat 小节中使用的数据集提供了一种简便的方法。安装: 1.安装devtools: install.packag…
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Error in split.default(seq_len(nrow(mat)), split) : group length is 0 but data length > 0
Error: Error in split.default(seq_len(nrow(mat)), split) : group length is 0 but data length > 0
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R: Load in data from 10X
Description Enables easy loading of sparse data matrices provided by 10X genomics. Usage Read10X( data.dir, gene.column …
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R:读取Excel的xls和xlsx格式文件
#安装加载readxl包 library(“readxl”) #读取xlsx文件 file<-read_excel(“xxx.xlsx”) #读取表sheet read_excel(xl…
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MacOS Homebrew 安装‘Permission denied’权限修复
错误: /opt/homebrew/Library/Taps/homebrew/homebrew-core/.git: Permission denied ==> Tapping homebrew/cask fatal: could …
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AUC分析和ROC Curve解读
在机器学习中,性能测量是一项必不可少的任务。因此,当涉及分类问题时,我们可以使用 AUC – ROC 曲线。当我们需要检查或可视化多类分类问题的性能时,我们会使用 AUC(Area Under the Receiver Oper…
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Star protocols:用于分析微生物学细胞图像的深度学习框架
Before you begin Deep learning (DL) has proven to be extremely effective in addressing a range of major biological chall…
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视网膜图像数据集Messidor MA Groundturth
MA介绍 Retinal image with Microaneurysms labeled 由于微动脉瘤(MA)在糖尿病视网膜病变(DR)诊断中的作用,视网膜图像中的微动脉瘤检测目前是一个活跃的研究领域。过去的大部分研究都集中在从视网膜图…