生物信息技术
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CellProfiler Analyst 基于机器学习的细胞荧光分析软件
CellProfiler Analyst(CPA)允许对数据进行交互式探索和分析,特别是来自高通量、基于图像的实验。它最受欢迎的功能是一个有监督的机器学习系统(”分类器”),它可以被训练来识别复杂和微妙的表型,用于对…
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ROC curve analysis-什么是ROC分析
What is a ROC curve? A ROC curve is a plot of the true positive rate (Sensitivity) in function of the false positive rat…
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ChatGPT 中文使用教程调教指南
ChatGPT模型是由OpenAI训练的大型语言模型,能够生成类人文本。通过向它提供提示,它可以生成继续对话或扩展给定提示的响应。 直接问它能干什么我是一个训练有素的大型语言模型,可以帮助你回答各种问题,比如关于政治、历史、科学、技术、艺术…
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VISION:Functional Interpretation for scRNA-seq Data
Preliminaries If you have yet to install VISION, we recommend installing the package from Github to install this package…
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Developmental cell:整合单细胞蛋白质组学和转录组学的人类乳腺图谱-A human breast atlas integrating single-cell proteomics and transcriptomics
Published:May 25, 2022DOI:https://doi.org/10.1016/j.devcel.2022.05.003 The breast is a dynamic organ whose response to p…
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ggsci:ggplot2科学期刊主题调色板
1.介绍 ggsci 提供一系列高质量的调色板,其灵感来自于科学期刊、数据可视化图书馆、科幻电影和电视节目中使用的颜色。.The color palettes in ggsci are available as ggplot2 scales…
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在Ubuntu 18.04上编译bcl2fastq v2.20
与MiSeq使用MiSeq Reporter自动将二进制碱基调用(BCL)文件转换为FASTQ格式不同,NextSeq、HiSeq和NovaSeq系统的输出需要用户开发的或第三方的数据分析工具,如bcl2fastq,来转换为FASTQ。除了…
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conda 安装R语言及其R
1.配置Conda镜像源 conda config –add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config –add chan…
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Cell Ranger – 6.1.2安装和使用
1.安装curl/wget curl -o cellranger-6.1.2.tar.gz “https://cf.10xgenomics.com/releases/cell-exp/cellranger-6.1.2.tar.gz?Expi…
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利用R读取h5ad文件
安装包 install.packages(“remotes”)remotes::install_github(“mojaveazure/seurat-disk”,force = TRUE) 加…