R
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R: 使用公共数据库构建癌症预后模型
## If you need to download other cancers, simply replace TCGA-LIHC with the corresponding cancer abbreviation in the fir…
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常用R包安装命令
if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE)) install.packages(“BiocManager”) BiocManager::install( c(“AnnoPr…
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R：circos.heatmap-绘制环形热图包
The circos.heatmap() function Circular heatmaps are pretty. With circlize package, it is possible to implement circular …
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安装Seurat-data包
SeuratData 是一种利用 R 的内部软件包和数据管理系统以 Seurat 对象形式分发数据集的机制。它为用户访问 Seurat 小节中使用的数据集提供了一种简便的方法。安装： 1.安装devtools： install.packag…
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Error in split.default(seq_len(nrow(mat)), split) : group length is 0 but data length > 0
Error： Error in split.default(seq_len(nrow(mat)), split) : group length is 0 but data length > 0
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R: Load in data from 10X
Description Enables easy loading of sparse data matrices provided by 10X genomics. Usage Read10X( data.dir, gene.column …
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R:读取Excel的xls和xlsx格式文件
#安装加载readxl包 library(“readxl”) #读取xlsx文件 file<-read_excel(“xxx.xlsx”) #读取表sheet read_excel(xl…
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AUC分析和ROC Curve解读
在机器学习中，性能测量是一项必不可少的任务。因此，当涉及分类问题时，我们可以使用 AUC – ROC 曲线。当我们需要检查或可视化多类分类问题的性能时，我们会使用 AUC（Area Under the Receiver Oper…
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ggsci:ggplot2科学期刊主题调色板
1.介绍 ggsci 提供一系列高质量的调色板，其灵感来自于科学期刊、数据可视化图书馆、科幻电影和电视节目中使用的颜色。.The color palettes in ggsci are available as ggplot2 scales…
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利用R读取h5ad文件
安装包 install.packages(“remotes”)remotes::install_github(“mojaveazure/seurat-disk”,force = TRUE) 加…
