单细胞测序
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scvi-tools:单细胞组学分析python库
scvi-tools ( https://scvi-tools.org/ ),是一个用于单细胞组学数据概率建模的软件包,建立在 PyTorch 和 AnnData 之上。 该软件包托管了几个模型的实现,这些模型执行广泛的单细胞数据分析任务,…
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单细胞 RNA 测序方法的比较分析Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods
单细胞RNA测序(scRNA-seq)为解决生物和医学问题提供了新的可能性。然而,缺乏对各种scRNA-seq协议性能的系统比较。我们从583个小鼠胚胎干细胞生成数据,以评估六种scRNA-seq方法:CEL-seq2、Drop-seq、M…
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空间转录组学分析包-Spatial transcriptomics Packages
Merfishtools – [Python] – MERFISHtools implement a Bayesian framework for accurately predicting gene or tran…
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3D UMAP R分析代码
# LOAD LIBRARIES ##### Restart Rstudio or R# Run the following code once you have Seurat installed library(ggplot2) libr…