UCSF ChimeraX(或简称 ChimeraX)是生物计算、可视化和信息学资源 (RBVI) 继 UCSF Chimera 之后的下一代分子可视化程序。 ChimeraX 可以免费下载,供学术、政府、非营利组织和个人使用。 商业用户,请参阅 ChimeraX 商业许可。
Matchmaker 工具(或 matchmaker 命令)便于叠加相关结构,而无需担心编号或遗漏残基。 它通过创建成对序列比对来叠加蛋白质或核酸,然后在 3D 中匹配序列比对的残基。 二级结构有助于指导序列比对,以便在更远相关且序列更难比对的蛋白质上获得更好的性能。 默认情况下,迭代拟合以排除结构上不同的区域并更紧密地叠加最相似的部分。
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官方网站:https://www.rbvi.ucsf.edu/chimerax/index.html
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