生物技术
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Linux操作系统:常用命令
Linux系统的命令通常都是如下所示的格式： 命令名称 [命名参数] [命令对象] 获取登录信息 – w / who / last/ lastb。 [root ~]# w 23:31:16 up 12:16, 2 users, …
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scvi-tools：单细胞组学分析python库
scvi-tools ( https://scvi-tools.org/ )，是一个用于单细胞组学数据概率建模的软件包，建立在 PyTorch 和 AnnData 之上。 该软件包托管了几个模型的实现，这些模型执行广泛的单细胞数据分析任务，…
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常见的培养细胞形态和细胞污染
1.成纤维细胞（或成纤维细胞样）细胞是双极或多极的，具有细长的形状，并附着在基质上生长。 2.上皮样细胞：呈多边形，尺寸更规则，并以离散斑块的形式附着在基质上。 3.淋巴母细胞样细胞呈球形，通常在悬浮液中生长而不附着在表面上。 4.酵母污染…
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NK细胞：分离扩增NK细胞、形态鉴定、表面标志物技术
NK细胞又称自然杀伤细胞(natural killer cell，NK细胞)，是机体内重要的免疫细胞，NK细胞形态上属于大颗粒淋巴细胞，来源于骨髓，是除T细胞、B细胞之外的第三大类淋巴细胞，约占血液中所有免疫细胞（白细胞数量）的15%，属于…
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常用载体测序引物选择和序列
载体名称和推荐引物：多个引物可根据酶切位点选用 序号 载体名称 正向引物 反向引物 1 pZeroBack/blunt PJET1.2-F PJET1.2-R 2 P3xFlag-CMV-14 CMV-30 CMV-24 3 P3xFlag…
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Perl拆分FASTA文件
将FASTA文件按照用户指定的序列条数进行拆分，即每n条序列写到一个文件中，或者按照指定的输出文件数进行拆分，则每个文件中包含的序列数相同 脚本名：splitFasta.pl #!/usr/bin/perl use strict; use …
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ggplot2绘图教程
直方图：geom_histogram 分组直方图的排列方式 position=”dodge” ggplot(small)+geom_histogram(aes(x=price, fill=cut), position=”dodge”) ht…
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STAMP:微生物物种与功能组成的可视化软件
STAMP是一款分析微生物物种与功能组成的可视化软件，STAMP 1.0于2010年发表在Bioinformatics杂志，后期2014年的2.0版本同样在Bioinformatics发布，目前最新版本为2.1.3。该软件除了能够绘制探索性…
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R：使用R连接数据库处理数据
1.数据库连接 library(DBI) library(dplyr) library(dbplyr) library(odbc) con <- dbConnect(odbc::odbc(), “Oracle DB”) 2.使用DBI…
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单细胞 RNA 测序方法的比较分析Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods
单细胞RNA测序（scRNA-seq）为解决生物和医学问题提供了新的可能性。然而，缺乏对各种scRNA-seq协议性能的系统比较。我们从583个小鼠胚胎干细胞生成数据，以评估六种scRNA-seq方法：CEL-seq2、Drop-seq、M…
