CHOPCHOP是用于选择CRISPR / Cas9,CRISPR / Cpf1,CRISPR / Cas13或NICKASE / TALEN定向诱变的目标位点的网络工具。
CHOPCHOP可以使用最少三个基本输入选项或附加高级参数来运行。基本输入包括:基因名称,基因组座标或粘贴的序列(包括RefSeq和ENSEMBL基因ID)。
越来越多的生物在CRISPR / Cas9,CRISPR / Cas9 Nickase,CRISPR / Cpf1或TALEN模式之间进行选择。
当然,该软件还支持本地运行,高级选项为用户提供了选择目标站点时的更多灵活性。如果您想在本地运行CHOPCHOP,则可以在此处下载该工具的命令行版本:https://bitbucket.org/valenlab/chopchop/src/main/
网址:https://chopchop.cbu.uib.no/
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