COVID19实时定量PCR检测序列和引物

名称	描述	引物序列(5’>3’)	标记	使用浓度
2019-nCoV_N1-F	2019-nCoV_N1 Forward Primer	5’-GAC CCC AAA ATC AGC GAA AT-3’	None	20 µM
2019-nCoV_N1-R	2019-nCoV_N1 Reverse Primer	5’-TCT GGT TAC TGC CAG TTG AAT CTG-3’	None	20 µM
2019-nCoV_N1-P	2019-nCoV_N1 Probe	5’-FAM-ACC CCG CAT TAC GTT TGG TGG ACC-BHQ1-3’	FAM, BHQ-1	5 µM
2019-nCoV_N2-F	2019-nCoV_N2 Forward Primer	5’-TTA CAA ACA TTG GCC GCA AA-3’	None	20 µM
2019-nCoV_N2-R	2019-nCoV_N2 Reverse Primer	5’-GCG CGA CAT TCC GAA GAA-3’	None	20 µM
2019-nCoV_N2-P	2019-nCoV_N2 Probe	5’-FAM-ACA ATT TGC CCC CAG CGC TTC AG-BHQ1-3’	FAM, BHQ-1	5 µM
2019-nCoV_N3-F	2019-nCoV_N3 Forward Primer	5’-GGG AGC CTT GAA TAC ACC AAA A-3’	None	20 µM
2019-nCoV_N3-R	2019-nCoV_N3 Reverse Primer	5’-TGT AGC ACG ATT GCA GCA TTG-3’	None	20 µM
2019-nCoV_N3-P	2019-nCoV_N3 Probe	5’-FAM-AYC ACA TTG GCA CCC GCA ATC CTG-BHQ1-3’	FAM, BHQ-1	5 µM
RP-F	RNAse P Forward Primer	5’-AGA TTT GGA CCT GCG AGC G-3’	None	20 µM
RP-R	RNAse P Reverse Primer	5’-GAG CGG CTG TCT CCA CAA GT-3’	None	20 µM
RP-P	RNAse P Probe	5’-FAM – TTC TGA CCT GAA GGC TCT GCG CG – BHQ-1-3’	FAM, BHQ-1	5 µM

1. ORF1 a/b序列
ATCGTGTTGTCTGTACTGCCGTTGCCACATAGATCATCCAAATCCTAAAGGATTTTGTGACTTAAAAGGTAAGTATGTACAAATACCTACAACTTGTGCTAATGACCCTGTGGGTTTTACACTTAAAAACACAGTCTGTACCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGGCTGTAGTTGTGATCAACTCCGCGAACCCATGCTTCAGTCAGCTGATGCACAATCGTTTTTAAACGGGTTTGCGGTGTAAGTGCAGCCCGTCTTACACCGTGCGGCACAGGCACTAGTACTGATGTCGTATACAGGGCTTTTGACATCTACAATGATAAAGTAGCTGGTTTTGCTAAATTCCTAAAAACTAATTGTTGTCGCTTCCAAGAAAAGGACGAAGATGACAATTTAATTGATTCTTACTTTGTAGTTAAGAGACACACTTTCTCTAACTACCAACATGAAGAAACAATTTATAATTTACTTAAGGATTGTCCAGCTGTTGCTAAACAT
2. N基因
ATGTCTGATAATGGACCCCAAAATCAGCGAAATGCACCCCGCATTACGTTTGGTGGACCCTCAGATTCAACTGGCAGTAACCAGAATGGAGAACGCAGTGGGGCGCGATCAAAACAACGTCGGCCCCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTCTTGGTTCACCGCTCTCACTCAACATGGCAAGGAAGACCTTAAATTCCCTCGAGGACAAGGCGTTCCAATTAACACCAATAGCAGTCCAGATGACCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTACCAGACGAATTCGTGGTGGTGACGGTAAAATGAAAGATCTCAGTCCAAGATGGTATTTCTACTACCTAGGAACTGGGCCAGAAGCTGGACTTCCCTATGGTGCTAACAAAGACGGCATCATATGGGTTGCAACTGAGGGAGCCTTGAATACACCAAAAGATCACATTGGCACCCGCAATCCTGCTAACAATGCTGCAATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGGAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGTTCCTCATCACGTAGTCGCAACAGTTCAAGAAATTCAACTCCAGGCAGCAGTAGGGGAACTTCTCCTGCTAGAATGGCTGGCAATGGCGGTGATGCTGCTCTTGCTTTGCTGCTGCTTGACAGATTGAACCAGCTTGAGAGCAAAATGTCTGGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCTTCTAAGAAGCCTCGGCAAAAACGTACTGCCACTAAAGCATACAATGTAACACAAGCTTTCGGCAGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAATTTTGGGGACCAGGAACTAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAGCGTTCTTCGGAATGTCGCGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCGGGAACGTGGTTGACCTACACAGGTGCCATCAAATTGGATGACAAAGATCCAAATTTCAAAGATCAAGTCATTTTGCTGAATAAGCATATTGACGCATACAAAACATTCCCACCAACAGAGCCTAAAAAGGACAAAAAGAAGAAGGCTGATGAAACTCAAGCCTTACCGCAGAGACAGAAGAAACAGCAAACTGTGACTCTTCTTCCTGCTGCAGATTTGGATGATTTCTCCAAACAATTGCAACAATCCATGAGCAGTGCTGACTCAACTCAGGCCTAA
3. E 基因
ATGTACTCATTCGTTTCGGAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGTATTCTTGCTAGTTACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCGATTGTGTGCGTACTGCTGCAATATTGTTAACGTGAGTCTTGTAAAACCTTCTTTTTACGTTTACTCTCGTGTTAAAAATCTGAATTCTTCTAGAGTTCCTGATCTTCTGGTCTAA

对照质粒图谱