生物信息技术

  • Navigator Error:check_hostname requires server_hostname

    An unexpected error occurred on Navigator start-up Main Error check_hostname requires server_hostname Traceback Tracebac…

    09/15/2021
    1.0K
  • 序列比对

    比较是科学研究中最常见的研究方法之一,通过比较寻找研究对象可能具备的某些特征和特性。序列比较的理论基础是进化学说:如果两个序列之间具有足够高的相似性,那么两者可能是共同的进化祖先经过序列内残基的替换,残基或序列片段的缺失或插入以及序列重组等…

    09/12/2021
    759
  • Mac常用快捷键

    Finder 快捷键 作用 备注 Command + ↑ 返回上一层 Command + ↓ 进入当前文件夹 Shift + Command + G 前往指定路径的文件夹 包括隐藏文件夹 Shift + Command + . 显示隐藏文件…

    Python 08/29/2021
    1.1K
  • R:字符大小写转换

    R:字符大小写转换 >x = “CAGGGT” #定义字符串变量x >tolower(x) [1] “caggt” #将x中的字符全部转换为小写字母 >y = tolower…

    R 08/10/2021
    635
  • CRISPR 设计和Off Target预测:tefor

    1.在线网站 http://crispor.tefor.net/ 2.界面简洁,step1输入KO的序列,step2/3中选择相应的选项即可获得信息。  

    07/15/2021
    1.1K
  • RNAseq:mRNA表达FPKM标准话原理和计算方法

    mRNA Expression HT-Seq Normalization RNA-Seq expression level read counts produced by HT-Seq are normalized using two si…

    06/26/2021
    829
  • 3D UMAP R分析代码

    # LOAD LIBRARIES ##### Restart Rstudio or R# Run the following code once you have Seurat installed library(ggplot2) libr…

    单细胞测序 06/23/2021
    882
  • R:Bioconductor设置国内镜像

    Bioconductor安装包出现无法打开url https://bioconductor.org/install/,可以通过修改国内镜像解决,代码如下: 运行安装命令 BiocManager::install(“DOSE&#8…

    01/09/2021
    1.3K
  • had non-zero exit status

    解决方案1:install.packages(‘*package_name’, dependencies = TRUE)

    Python 11/07/2020
    737
  • edgeR:RNAseq差异基因比较

    Empirical analysis of digital gene expression data in R 安装: source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)bioc…

    08/14/2020
    687