核酸和蛋白质的计算:分光光度法的转换表

本网页提供了几个有用的常见生物常数和转换表。这些包括公制前缀、分光光度计转换、不同浓度的琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶分辨率等。你可以使用这些表格来帮助你的DNA/RNA/蛋白质定量、电泳凝胶制备、蛋白质合成和其他研究。

Metric Prefixes

Prefix Symbol Factor
kilo k 103
centi c 10-2
milli m 10-3
micro µ 10-6
nano n 10-9
pico p 10-12
femto f 10-15
atto a 10-18
zepto z 10-21

分光光度法的转换

1 A260 unit of double-stranded DNA=50 µg/ml
1 A260 unit of single-stranded DNA=33 µg/ml
1 A260 unit of single-stranded RNA=40 µg/ml

DNA摩尔转换

1 µg of 1,000 bp DNA
1.52 pmol(3.03 pmol of ends)
1 µg of pBR322 DNA
0.36 pmol DNA
1 pmol of 1,000 bp DNA
0.66 µg
1 pmol of pBR322 DNA
2.8 µg

pBR322DNA:(4,361 bp) 

DNA摩尔转换的公式

For dsDNA
To convert pmol to µg:
pmol × N × 660 pg/pmol × 1 µg/106 pg = µg
To convert µg to pmol:
µg × 106 pg/1 µg × pmol/660 pg × 1/N = pmol
For ssDNA
To convert pmol to µg:
pmol × N × 330 pg/pmol × 1µg/106 pg = µg
To convert µg to pmol:
µg × 106 pg/1 µg × pmol/330 pg × 1/N = pmol
where N is the number of nucleotides and 330 pg/pmol is the average MW of a nucleotide

蛋白质摩尔转换

100 pmol of 100 kDa protein
=
10 µg
100 pmol of 50 kDa protein
=
5 µg
100 pmol of 10 kDa protein
=
1 µg
100 pmol of 1 kDa protein
=
100 ng

Protein/DNA 转换

1 kb DNA
333 amino acids
37 kDa protein
270 b DNA
10 kDa protein
810 b DNA
30 kDa protein
1.35 kb DNA
50 kDa protein
2.7 kb DNA
100 kDa protein
average MW of an amino acid
110 daltons
Dalton (Da) is an alternate name for the atomic mass unit, and kilodalton (kDa) is 1,000 daltons. Thus a protein with a mass of 64 kDa has a molecular weight of 64,000 grams per mole

Agarose Gel(%):线性DNA的解析

Recommended % Agarose浓度 Optimum Resolution for Linear DNA
(Size of fragments in nucleotides;bp)
0.5 1,000-30,000
0.7 800-12,000
1.0 500-10,000
1.2 400-7,000
1.5 200-3,000
2.0 50-2,000

Polyacrylamide Gel(%):Resolution of Protein

Recommended % Acrylamide Protein Size Range
8 40-200 kDa
10 21-100 kDa
12 10-40 kDa

Length/M.W. of Common Nucleic Acids.

Nucleic Acid Number of Nucleotides Molecular Weight
lambda DNA 48,502(dsDNA) 3.2 × 107
pBR322DNA 4,361(dsDNA) 2.8 × 106
28S rRNA 4,800 1.6 × 106
23S rRNA(E.coli) 2,900 1.0 × 106
18S rRNA 1,900 6.5 × 105
16S rRNA(E.coli) 1,500 5.1 × 105
5S rRNA(E.coli) 120 4.1 × 104
tRNA(E.coli) 75 2.5 × 104
*Molecular weights based on actual sequence.

Standards

1. Average MW of dsDNA base pair = 600.
2. Average MW of ssDNA base =330.
3. Average MW of RNA base =340.

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