生物技术
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NCBI SRA Toolkit介绍
SRA Toolkit The Sequence Read Archive (SRA Toolkit) stores raw sequence data from “next-generation” sequenci…
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CS229 机器学习课程复习材料-概率论
CS229 机器学习课程复习材料-概率论 概率论复习和参考 概率论是对不确定性的研究。通过这门课，我们将依靠概率论中的概念来推导机器学习算法。这篇笔记试图涵盖适用于CS229的概率论基础。概率论的数学理论非常复杂，并且涉及到“分析”的一个分…
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机器学习：数学基础知识
数学基础知识 高等数学 1.导数定义： 导数和微分的概念 （1） 或者： （2） 2.左右导数导数的几何意义和物理意义 函数在处的左、右导数分别定义为： 左导数： 右导数： 3.函数的可导性与连续性之间的关系 Th1: 函数在处可微在处…
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Alphafold3安装
You will need a machine running Linux; AlphaFold 3 does not support other operating systems. Full installation requires …
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AlphaFold 3学习笔记-input输入格式（1）
AlphaFold 3可以模拟由以下一种或多种生物分子类型组成的结构：蛋白质、DNA、RNA 生物学上常见的配体：ATP、ADP、AMP、GTP、GDP、FAD、NADP、NADPH、NDP、血红素、血红素 C、肉豆蔻酸、油酸、棕榈酸、柠檬…
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RSEM: rsem-calculate-expression – Estimate gene and isoform expression from RNA-Seq data
SYNOPSIS rsem-calculate-expression [options] upstream_read_file(s) reference_name sample_name rsem-calculate-expression …
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R：RNA-seq分析包合集
RNA-seq alevin-fry – [Rust] – Rapid, accurate and memory-frugal preprocessing of single-cell and single-nuc…
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线粒体动力学的分子机制-Molecular mechanisms of mitochondrial dynamics
线粒体不仅合成细胞功能所需的能量，还参与多种细胞途径，包括细胞凋亡、钙稳态、炎症和免疫。线粒体是经历裂变和融合循环的动态细胞器，这些碎片化和超融合网络之间的转变确保了线粒体功能，使其能够适应代谢变化或细胞应激。线粒体形态缺陷与多种疾病有关，…
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R包：EDASeq–RNA-Seq 的数据分析和标准化
Davide Risso 1Introduction In this document, we show how to conduct Exploratory Data Analysis (EDA) and normalization fo…
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iGenomes:Ready-To-Use Reference Sequences and Annotations (update-2024-08-15)
The iGenomes are a collection of reference sequences and annotation files for commonly analyzed organisms. The files hav…
