生物技术
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iGenomes:Ready-To-Use Reference Sequences and Annotations (update-2024-08-15)
The iGenomes are a collection of reference sequences and annotation files for commonly analyzed organisms. The files hav…
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R:integrating and analysis single-cell datasets
Introduction In this notebook I will go over several integration techniques for single-cell -omics data. These technique…
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R package install ERROR: tidyverse-textshaping-ragg no-zero status
将程序包安装入‘/home/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.4’ (因为‘lib’没有被指定) 还安装依赖关系‘textshaping’ 试开URL’https://cloud.r-project.org/s…
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Cellranger分析10X Genomics single-cell RNA-seq data单细胞原始数据
cellranger是处理从 10X Genomics 平台生成的单细胞 RNA-seq 数据的命令行工具。cellranger 由 10X Genomics 构建，专门用于处理从其平台生成的数据，然而有几种开源工具可以与 cellrang…
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tmux:Linux上的终端多开后台神器 安装使用 tmux-3.4.tar.gz
tmux（terminal multiplexer）是Linux上的终端复用神器。 To build and install tmux from a release tarball, use: ./configure && …
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R: 使用公共数据库构建癌症预后模型
## If you need to download other cancers, simply replace TCGA-LIHC with the corresponding cancer abbreviation in the fir…
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常用R包安装命令
if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE)) install.packages(“BiocManager”) BiocManager::install( c(“AnnoPr…
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EGFP/GFP-Enhanced green fluorescent protein sequence序列
绿色荧光蛋白，是一个由约238个氨基酸组成的蛋白质，从蓝光到紫外线都能使其激发，发出绿色荧光。绿色荧光蛋白(Green Fluorescent Protein, GFP),通常称作增强型绿色荧光蛋白(Enhanced Green Fluor…
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FAK磷酸化和磷酸化的细胞生物学功能
FAK 蛋白包含四个不同的结构域：催化激酶核心位于 N 端 FERM（带 4.1、ezrin、radixin、moesin）结构域和 C 端 FAT（粘着斑靶向）结构域之间，以及非结构化富含脯氨酸区域 存在于催化域和 FAT 域之间。 表 …
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RNA-OUT的无抗生素选择系统-RNA-OUT based antibiotic-free selection system
在插入序列10 (IS10) 系统中，RNA-OUT RNA 与RNA-IN RNA 杂交，并减少下游IS10 转座酶基因的翻译。 从质粒中设计出 pLac 表达的 RNA-OUT，该质粒微弱地抑制单拷贝整合 pR-RNA-IN-lacZ …
