MFI: 用image J测量计算荧光染色的mean fluorescence intensity

1、加开图像后,提取出单一通道(Image-Color-Split Channels)

2、调整阈值,选择适当的区域(Image-Adjust-Threshold)

注意:

  1. 如果图片上有比例尺,必须调节Threshold,或者框选比例尺的区域Edit-Fill,从而去掉比例尺,否则会影响结果。
  2. 务必用Red来表征选中区域。
  3. 荧光图片的背景通常是黑的,所以需要勾选Dark Background!!
  4. 不用点击Apply、Set等按键,红色部分其实已经选中了。

另外,不同Threshold算法会带来不同的结果,如果默认算法(Default)设定的阈值不符合要求,需要重新选择算法。

3、选择合适阈值算法(Image-Adjust-Auto Threshold)

4、设定需要测量的参数(Analyze-Set Measurements)

5、测量(Analyze-Measure):点击Measure后弹出检测结果:

Mean即为平均荧光强度。(Mean即Mean gray value,等于IntDen/Area),IntDen=Integrated Density(荧光强度总和)

可以将结果复制到Excel或者直接导出生成csv文件(Results窗口-File-Save as)
免疫荧光是半定量分析,平均荧光强度只能半定量地表征特异性蛋白的表达

主要是因为免疫荧光实验中的人为因素太多,例如拍照时的曝光、焦距等等,而且非特异性结合的因素也不能完全消除。所以我们在拍照的时候,以及处理数据的时候,一定要有一个固定的标准和流程,从而减小误差。

注意:平均荧光强度并不等于免疫组化中的光密度(Optical Density),所以不需要Invert以及Calibration。单位可以用Arbitrary Units(AU)。

如若转载,请注明出处:https://www.ouq.net/1953.html

(0)
打赏 微信打赏,为服务器增加50M流量 微信打赏,为服务器增加50M流量 支付宝打赏,为服务器增加50M流量 支付宝打赏,为服务器增加50M流量
上一篇 07/23/2022 17:26
下一篇 07/27/2022

相关推荐

  • Transwell孔径0.4um3um8um选择原则

    在实验中使用Transwell®通透性支持物时选择合适的孔径也是十分重要的。常用最小孔径的Tanswell膜(0.4um )主要应用于药物转导研究。细胞侵袭,趋化性和运动性研究通常采用3.0um或以上的孔径的Tranwell膜。 细胞从膜的…

    05/06/2024
    60
  • FACS:细胞染色背景高、特异性低如何处理

    如何固定和渗透细胞(小鼠和人类)以进行特异性细胞内染色: 1: 我们常规使用的一种廉价而有效的方法是用 10%缓冲福尔马林溶液在 4°C 下固定 15-30 分钟,然后用 TBST(0.2% TritonX-100)在室温下透化细胞 20 …

    实验技术 10/27/2023
    232
  • Matrigel使用:包被成功判断与絮状物

    涂有Matrigel的盘子或平板在室温(约21°C)下孵化1小时,或在4°C的冰箱中孵化一夜后即可使用。它们可以在4°C下储存达一周。孵化或储存在冰箱中时,应使用干净的保鲜膜(或同等的材料)覆盖以防止溢出。避免倾斜以防止Matrigel的表…

    04/26/2022
    216
  • 如何设计质粒载体

    设计质粒载体是一项复杂而有趣的任务,通常需要考虑到载体的用途、宿主细胞类型、表达水平、选用的启动子、标签等多个因素。以下是设计质粒载体的一些建议步骤: 明确研究目的: 定义质粒的主要用途,是用于表达蛋白质、RNA干扰、基因编辑等。 确定宿主…

    实验方法 12/27/2023
    255
  • 从小鼠皮肤伤口分离巨噬细胞用于单细胞RNA测序

    了解组织修复中的巨噬细胞异质性是一个重大挑战。在这里,我们描述了一个协议,它结合了从皮肤伤口中分离免疫细胞和随后基于流式细胞仪的伤口巨噬细胞分拣和单细胞RNA测序。我们使用原始Smart-seq2协议的修改版来提高速度和准确性。该协议对于分…

    04/26/2022
    223