MFI: 用image J测量计算荧光染色的mean fluorescence intensity

1、加开图像后,提取出单一通道(Image-Color-Split Channels)

2、调整阈值,选择适当的区域(Image-Adjust-Threshold)

注意:

  1. 如果图片上有比例尺,必须调节Threshold,或者框选比例尺的区域Edit-Fill,从而去掉比例尺,否则会影响结果。
  2. 务必用Red来表征选中区域。
  3. 荧光图片的背景通常是黑的,所以需要勾选Dark Background!!
  4. 不用点击Apply、Set等按键,红色部分其实已经选中了。

另外,不同Threshold算法会带来不同的结果,如果默认算法(Default)设定的阈值不符合要求,需要重新选择算法。

3、选择合适阈值算法(Image-Adjust-Auto Threshold)

4、设定需要测量的参数(Analyze-Set Measurements)

5、测量(Analyze-Measure):点击Measure后弹出检测结果:

Mean即为平均荧光强度。(Mean即Mean gray value,等于IntDen/Area),IntDen=Integrated Density(荧光强度总和)

可以将结果复制到Excel或者直接导出生成csv文件(Results窗口-File-Save as)
免疫荧光是半定量分析,平均荧光强度只能半定量地表征特异性蛋白的表达

主要是因为免疫荧光实验中的人为因素太多,例如拍照时的曝光、焦距等等,而且非特异性结合的因素也不能完全消除。所以我们在拍照的时候,以及处理数据的时候,一定要有一个固定的标准和流程,从而减小误差。

注意:平均荧光强度并不等于免疫组化中的光密度(Optical Density),所以不需要Invert以及Calibration。单位可以用Arbitrary Units(AU)。

如若转载,请注明出处:https://www.ouq.net/1953.html

(0)
打赏 微信打赏,为服务器增加50M流量 微信打赏,为服务器增加50M流量 支付宝打赏,为服务器增加50M流量 支付宝打赏,为服务器增加50M流量
上一篇 07/23/2022 17:26
下一篇 07/27/2022

相关推荐

  • Transwell孔径0.4um3um8um选择原则

    在实验中使用Transwell®通透性支持物时选择合适的孔径也是十分重要的。常用最小孔径的Tanswell膜(0.4um )主要应用于药物转导研究。细胞侵袭,趋化性和运动性研究通常采用3.0um或以上的孔径的Tranwell膜。 细胞从膜的…

    05/06/2024
    103
  • CRISPR质粒区别

    PX330; SpCas9 and single guide RNA PX458; SpCas9-2A-EGFP and single guide RNA PX459; SpCas9-2A-Puro and single guide RNA…

    实验方法 04/07/2024
    295
  • 如何设计质粒载体

    设计质粒载体是一项复杂而有趣的任务,通常需要考虑到载体的用途、宿主细胞类型、表达水平、选用的启动子、标签等多个因素。以下是设计质粒载体的一些建议步骤: 明确研究目的: 定义质粒的主要用途,是用于表达蛋白质、RNA干扰、基因编辑等。 确定宿主…

    实验方法 12/27/2023
    315
  • 常用通用测序引物名称和序列

    本文列出一代测序常用的通用引物,一般由测序公司免费提供。 引物名称 引物序列 27F AGAGTTTGATCMTGGCTCAG 1492R GGTTACCTTGTTACGACTT 86F GCTCAGTAACACGTGG 1340R CGG…

    实验方法 12/15/2023
    823
  • 实验兔的解剖学特征和生理学特性

    兔(Rabbit)是 哺乳类 兔形目 兔科 下属所有的属的总称。 生物学 分类动物界 脊索动物门 脊椎动物亚门 哺乳纲 兔形目 。 1、一般特性及生活习性 家兔虽然经人类长期的驯化和培育已成为一种常用的实验动物,但仍然继承了其祖先野生穴兔的…

    实验方法 12/13/2023
    1.0K