AMIC All MIcroarray Clusterings芯片聚类

用于基因芯片基因表达数据的轻量级多方法聚类引擎。
具有 Euclidean distance、Pearson coefficient、City block distance、Cosine similarity、Spearman rank correlation 、Kendall分析方式
AMIC All MIcroarray Clusterings芯片聚类
  • AMIC @是一种高度交互的工具,通过采用AJAX技术来强调用户友好性和鲁棒性,因此可以有效地交错执行不同的聚类算法并检查结果。
  • 在AMIC @提供的显着功能中,包括:(i)自动文件格式检测,(ii)使用基于Tibshirani等人的基于稳定性的方法的变体来建议群集数量。(iii)通过热图直观直观地检查数据,以及(iv)使用聚类均一性对聚类质量进行测量。
  • 通过选择专门为此目的设计的算法(例如FPF-SB和k-Boost),可以有效地处理大型数据集。
  • 如果数据集非常大,则用户可以通过群集向导选择系统的批处理模式,该向导可以一次运行所有算法,并通过电子邮件发送结果。
  • Cluster heat map
  • AMIC All MIcroarray Clusterings芯片聚类

PubMed Link: AMIC@: All MIcroarray Clusterings @ once

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