R
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R:读取Excel的xls和xlsx格式文件
#安装加载readxl包 library(“readxl”) #读取xlsx文件 file<-read_excel(“xxx.xlsx&#…
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AUC分析和ROC Curve解读
在机器学习中,性能测量是一项必不可少的任务。因此,当涉及分类问题时,我们可以使用 AUC – ROC 曲线。当我们需要检查或可视化多类分类问题的性能时,我们会使用 AU…
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ggsci:ggplot2科学期刊主题调色板
1.介绍 ggsci 提供一系列高质量的调色板,其灵感来自于科学期刊、数据可视化图书馆、科幻电影和电视节目中使用的颜色。.The color palettes in ggsci a…
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利用R读取h5ad文件
安装包 install.packages(“remotes”)remotes::install_github(“mojaveazure/seur…
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R:使用clusterProfiler进行DAVID GO富集分析
require(DOSE) require(clusterProfiler) data(geneList) gene = names(geneList)[abs(geneList)…
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R:使用GOplot对GO分析结果作图
安装 # Installation of the latest released version install.packages(‘GOplot’) # Installation…
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R:UniProt.ws包转换Accession,ENSEMBL,ENSEMBL_PROTEIN等
UniProt.ws提供了一个通往UniProt网络服务的选择查询接口。UniProt.ws是与Bioconductor的Uniprot网络服务互动的基础包。 与Annotatio…
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R:计算数据框中每一行的标准偏差
RowSD = function(x) {sqrt(rowSums((x – rowMeans(x))^2)/(dim(x)[2] – 1))}
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rconfig:在命令行管理 R 配置
Configuration management using files (JSON, YAML, separated text), JSON strings, and comma…
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SCENIC:cisTarget databases数据库下载
List of databases for the cisTarget family of tools (e.g. RcisTarget, SCENIC/pySCENIC, and…